“这些地方的主官，要由九卿廷推。”
“管辖的藩属则由理藩院管辖，理藩院派遣官员，在这些地方做属官。”
“涉及藩属的事务，必须由理藩院官员副署，符合理藩院条例。”
以此解决理藩院和枢密院的争议。
黄立极是没胆子反抗皇帝的，但是他也得为理藩院争夺权力，脑筋转动说道：
“自贸区没有卫所、也不用派遣政务官员，应当归属理藩院。”
“这些地方是藩属还是大明帝国领土，恳请陛下决断。”
朱由检想着这些自贸区的作用，思索之后说道：
“自贸区仿照藩属评定星级，具体是哪一星按其人口、实力和上缴的赋税决定。”
“它们由自贸区居民自治，理藩院和当地所属督抚、藩属监管。”
把自贸区作为共同管辖的土地，没有划入大明帝国里面。
不过大明帝国派遣的督抚是能监察它们的，对各个自贸区也有一定影响力。
朱由检这么做，自然是为了多设些自贸区，让设立自贸区的藩属减少抵触情绪。
他对在海外扩张直辖领土是不怎么热心的，因为他知道以现在的交通和通信条件，根本管不过来。
成宣之后大明在海外设立的巡检司等据点逐渐消失，就是因为无法维持长久的控制力。
有鉴于此，朱由检倾向于把海外分封，只在重要地方设立军民府，作为大明帝国的直辖土地。
自贸区则作为类似租界的地方让居民自治，大明维护它们的地位，方便大明公民通过自贸区自由贸易。
这些划分出来后，群臣开始认识到帝国和天朝的不同，更加认识到理藩院的权力。首辅韩爌不满道：
“陛下，朝廷治理天朝，陛下治理帝国之外的地方为何专用理藩院？”
“臣等身为朝廷大臣，理当辅佐陛下治理整个天朝。”
朱由检一时语塞，眼看群臣纷纷这样说，只能向他们道：
“贵族议会都被纳入国会了、理藩院也是朝廷五院之一，朝廷自然可以治理藩属。”
“只不过藩属的情况复杂，需要理藩院专理。”
“如果你们有想法，可以通过朝议、廷议，向朕提出建议。”
对群臣稍作让步，却仍旧没有把理藩院让出去。群臣想要干涉理藩院，只能通过天子。
朱由检仍旧掌握着对理藩院直接下旨的权力，不需要通过内阁和六科。
这是之前他许诺不随意用中旨时争取的，韩爌等大臣想要推翻，都没什么底气：