，同时收复哈密等卫，重新建立起大明在西域的统治秩序。
除了对西域的经略以外，对于青海也不能放过，青海西通瓜沙哈密诸地，南通四川松潘、茂州等处，东临洮岷及庄、浪等地，又与河套相连，是陕西三边的腹地，如果青海安定的话，陕西三边也能够得以消停。
现在住牧于青海的是俺答的第四子丙兔，这孙子不是个什么好鸟，还有他的儿子真相台吉，也不是什么消停的主，多次袭扰河州等处，从嘉靖三十九年俺答西征以来，就在青海做大了，如果不加以控制，日后必然成为大明的心腹大患。
马芳在奏疏中也奏称：“自东虏丙兔遗流窃住西海，每渡河而南，驻牧莽剌川一带，逼近洮、河疆境，垂涎番族，睥睨内地，是以洮、河昔年止于防番，今则又防虏矣。”
丙兔给大明的陕西三边造成了沉重的边防压力，朱载坖于是取出地图，和一众臣子们比照地图，思考办法，现在大明要做的当务之急就是将青海和土默特本部给隔绝开来，要达到这个目的，那就必须要收复关西七卫，截断北虏从新疆前往青海的道路。
要达到这个目的，大明就必须西征，兵出嘉峪关，先收复玉门、沙州、瓜州、敦煌，然后转而南下，翻阅当金山口，收复安定卫，才算彻底截断北虏和海虏之间的交往，然后官军要回到敦煌，从安西出发，沿河北上，收复哈密卫，对于官军来说，简直是不可能完成的任务。
官军不仅要转战数千里，还有穿越戈壁沙漠，在高原上和蒙古人作战，翻阅雪山，其作战难度之大，后勤保障的艰难，可想而知，连朱载坖查看了地图之后，都感觉到一阵无奈。
朱载坖知道，官军要完成这样的作战，不可能是一蹴而就的，必须得详细规划，充分准备，一步一步来，而朱载坖认为第一步就是兵出嘉峪关，收复玉门。
朱载坖已经下令原本的赤斤蒙古卫改称玉门卫，作为离嘉峪关最近的关西七卫，出嘉峪关西行二十里曰大草滩，又三十里曰黑山儿，又七十里曰回回墓，墓西四十里曰骟马城，并设墩台，置卒。城西八十里即玉门卫，距离嘉峪关仅二百二十里。
朱载坖认为，应该立即下令收复玉门卫，将之作为收复关西七卫的攻击出发阵地和后勤转运点。收复了玉门之后，就可以趁机收复沙州卫，将汉唐的安西、敦煌故地渐次收复。
朱载坖对诸位重臣们说道：“西域乃汉唐之故土，失之已近千年矣。今本朝举兵收之，乃恭行天讨也。不意汉家儿郎，今又复出玉门关外矣！”
朱载坖要求各部院积极支持陕西三