山西将门的形成主要是由于宣大山西三镇战事频仍，血战之下涌现出很多将门世家，他们父子兄弟同在军中奋战的大有人在，这种情况之下再加上近几十年和俺答的不断战事，山西将门人才辈出是很正常的。
而最后一个就是三边将门，它的形成兼有山西和辽东将门的特点，一方面西北也是环境恶劣，军镇众多，外地的军官们不愿调来，另一方面三边也是战事异常频繁的地方，最为著名的就是固原镇的麻家将，右玉籍武将共有83名，其中麻家将一门就有33人之多，占了总数的将近四成，这种将门的抬头，并不是什么好事。
所以朱载坖和杨博、霍冀等人商量之后，决定将辽东和三边的将领对调，而山西的将领，则主要和蓟镇、京营、亲军诸卫的将领对调，同时将新科的武进士们优先向辽东和三边分配。
除了军官们的调动之外，还有就是家丁的问题，对于家丁这个问题，朱载坖和杨博、霍冀等人还有九边的总督们商量了之后认为，现在现在的情况了，完全不让将领拥有家丁是不现实的，各级军官们需要一些家丁来统御部队，但是官军家丁化是绝不可取的。
朱载坖不会容忍大明官军沦为将帅的家丁的，所以朱载坖和杨博等人商议了之后认为，按照职务的大小，限制随任携带的家丁数量，提督三百五十人，总兵二百人，然后依次减少。
朱载坖将这些要求给马芳等人说了之后，三位提督都表示同意，因为是第一次在九边范围内进行大调动，所以朱载坖允许三位提督举荐自己认为合适的将领，尤其是在总兵等要害岗位的选择上，以后总督、提督的意见都很重要。
在交代完这些事情之后，朱载坖单独留下马芳，朱载坖笑着问道：“丰州伯，将你从宣大调至三边，可有怨言啊？”
马芳赶紧说道：“臣愿为陛下效犬马之劳，何论东西。”
朱载坖问道：“知道为什么要调你去三边吗？”
马芳说道：“还是为了俺答？”
朱载坖点点头，马芳作为老将，嗅觉是极其敏锐的，他很清楚，随着和俺答的封贡达成，看起来大明和土默特部实现了和平，但是无论是大明还是俺答，都很清楚，只不过是权宜之计罢了，俺答要图谋瓦剌和青海，大明要休养生息，彼此各取所需罢了。
朱载坖说道：“丰州伯说的不错，封贡达成，九边最可忧者，就是一东一西了，最东面的蓟辽，有土蛮部和女真人的威胁，而西边的三边，有俺答和瓦剌的威胁。”
朱载坖之所说派马芳前去，就是看好马芳善用骑兵，善于训练骑兵